MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 24631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014796	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014796	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014796	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014796	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376214
5	NC_014796	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376214
6	NC_014796	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376214
7	NC_014796	T	7	7	256	262	0 %	100 %	0 %	0 %	392376214
8	NC_014796	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	392376214
9	NC_014796	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	392376214
10	NC_014796	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	392376214
11	NC_014796	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376214
12	NC_014796	A	7	7	478	484	100 %	0 %	0 %	0 %	392376214
13	NC_014796	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	392376214
14	NC_014796	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376214
15	NC_014796	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376214
16	NC_014796	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	392376214
17	NC_014796	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376214
18	NC_014796	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376214
19	NC_014796	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	392376214
20	NC_014796	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376214
21	NC_014796	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376214
22	NC_014796	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376214
23	NC_014796	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376214
24	NC_014796	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376214
25	NC_014796	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376214
26	NC_014796	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376214
27	NC_014796	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014796	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014796	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376215
30	NC_014796	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	392376215
31	NC_014796	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	392376215
32	NC_014796	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376215
33	NC_014796	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
34	NC_014796	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	392376215
35	NC_014796	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376215
36	NC_014796	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
37	NC_014796	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	392376215
38	NC_014796	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
39	NC_014796	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376215
40	NC_014796	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376215
41	NC_014796	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	392376215
42	NC_014796	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376215
43	NC_014796	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376215
44	NC_014796	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376215
45	NC_014796	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
46	NC_014796	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
47	NC_014796	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376215
48	NC_014796	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376215
49	NC_014796	T	6	6	2210	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	392376215
50	NC_014796	T	8	8	2289	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	392376215
51	NC_014796	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376215
52	NC_014796	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376215
53	NC_014796	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	392376215
54	NC_014796	T	8	8	2617	2624	0 %	100 %	0 %	0 %	392376216
55	NC_014796	T	8	8	2629	2636	0 %	100 %	0 %	0 %	392376216
56	NC_014796	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376216
57	NC_014796	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376216
58	NC_014796	TCC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392376216
59	NC_014796	T	6	6	2730	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	392376216
60	NC_014796	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376216
61	NC_014796	GA	3	6	2786	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	392376216
62	NC_014796	TTA	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376216
63	NC_014796	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	392376216
64	NC_014796	T	6	6	2885	2890	0 %	100 %	0 %	0 %	392376216
65	NC_014796	T	6	6	2897	2902	0 %	100 %	0 %	0 %	392376216
66	NC_014796	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376216
67	NC_014796	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	392376216
68	NC_014796	TAT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376216
69	NC_014796	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	392376216
70	NC_014796	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376216
71	NC_014796	T	6	6	3011	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	392376216
72	NC_014796	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014796	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014796	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014796	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014796	GAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
77	NC_014796	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	392376217
78	NC_014796	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	392376217
79	NC_014796	GA	3	6	3340	3345	50 %	0 %	50 %	0 %	392376217
80	NC_014796	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	392376217
81	NC_014796	ATG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
82	NC_014796	AGT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
83	NC_014796	CTT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376217
84	NC_014796	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376217
85	NC_014796	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
86	NC_014796	ATC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376217
87	NC_014796	TGG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376217
88	NC_014796	AGA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
89	NC_014796	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	392376217
90	NC_014796	TAA	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376217
91	NC_014796	AT	3	6	4227	4232	50 %	50 %	0 %	0 %	392376217
92	NC_014796	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
93	NC_014796	AGC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376217
94	NC_014796	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376217
95	NC_014796	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	392376217
96	NC_014796	AGA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
97	NC_014796	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376217
98	NC_014796	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
99	NC_014796	GAT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
100	NC_014796	GCT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376217
101	NC_014796	CT	3	6	4729	4734	0 %	50 %	0 %	50 %	392376217
102	NC_014796	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
103	NC_014796	CTGTGG	2	12	4820	4831	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392376217
104	NC_014796	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
105	NC_014796	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376217
106	NC_014796	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
107	NC_014796	AGA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
108	NC_014796	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376217
109	NC_014796	CAA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376217
110	NC_014796	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	392376217
111	NC_014796	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014796	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014796	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014796	T	7	7	5457	5463	0 %	100 %	0 %	0 %	392376218
115	NC_014796	AGA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376218
116	NC_014796	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	392376218
117	NC_014796	TGG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376218
118	NC_014796	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376218
119	NC_014796	GTT	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376218
120	NC_014796	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376218
121	NC_014796	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
122	NC_014796	TGT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376218
123	NC_014796	GGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392376218
124	NC_014796	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	392376218
125	NC_014796	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376218
126	NC_014796	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
127	NC_014796	GAT	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
128	NC_014796	TGT	3	9	5983	5991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376218
129	NC_014796	TGA	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
130	NC_014796	GCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376218
131	NC_014796	T	7	7	6072	6078	0 %	100 %	0 %	0 %	392376218
132	NC_014796	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376218
133	NC_014796	TGA	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
134	NC_014796	GAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376218
135	NC_014796	A	6	6	6278	6283	100 %	0 %	0 %	0 %	392376218
136	NC_014796	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392376218
137	NC_014796	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376218
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